这座始建于明崇祯三十年（1640）的庙，最初设于大型的蒙古包内，因庙后山包上有一座敖包而得名。清乾隆十七年（1752年）重建，第三次建于清嘉庆六年（1801年），朝廷理藩院赐匾“普恩寺”。第四次建于清同治三年（1864年），为十二世夏利宛活佛主持兴建，是历代夏律宛呼图克图活佛居住之处。
土木结构的庙建于1872年，由高大的的活佛经堂、佛塔、禅房等组成。据说，敖包特庙在鼎盛时期，有大小喇嘛550多人，经堂龛下的地窖里黄金白银多达数百万，另有1万多只羊，700多匹马，300多头牛，90余峰骆驼。但由于近代新疆动荡不安，边陲草原战乱不息，喇嘛庙又居城北小土山上，屡遭拆毁，抢掠，到新中国成立时，庙里的财产已所剩无几。
如今看到的敖包特库热庙为2003年重新修建的，建筑面积246平方米，其中庙堂建筑122平方米，庙堂仍为土木结构。目前，敖包特库热庙共有喇嘛50多人。
每逢法会日，喇嘛们身着贵重的绸缎及独特的头冠，身坐“加布次”禅座上，手持丈余长的铜管喇叭，雄浑昂扬的念径声飘绕四野，成为这里独特的人文景观。
最吸引人的是庙门前的八座宝塔，这是仿照黄教祖庭青海塔尔寺的八座如意圣塔而建立起来的。据说，这八个塔是为纪念佛祖释迦牟尼一生之中的八大功德而建造的。
八座如意宝塔的造型大同小异，塔身白灰抹面，底座青砖砌成，腰部装饰有经文，每个塔身南面还有一个佛龛，里面藏有梵文。最后一个塔最与众不同，全身洁白没有任何图案，代表释迦牟尼的涅槃，象征着庄严和肃穆。仔细观察可以发现塔的底部呈方形，像叠起的衣物，上部则像一个倒置的钵，这种造型象征着“衣钵相传”。
现在我们看寺庙大门正上方的屋檐，上面有两只鹿俯卧在地，中间是一个金色的大法轮，象征着释迦牟尼在鹿野苑第一次阐述佛教义理，后人称为初转法轮。
在寺庙正前方的大门左、右墙壁上画的是佛教中的四大天王，被中国化以后，俗称为风、调、雨、顺四大天王。在左方内侧墙壁上，是藏传佛教的一幅典型图画，叫《和气四瑞图》。画上有一只大象，大象背上蹲着一只猴子，猴子肩上扛着一只兔子、兔子头顶上站立着一只羊角鸡。这幅画表示和平和谐，是根据佛祖释迦牟尼讲述的故事所画。
在右边内侧的墙壁上，可以看到是一幅典型的汉文化图，画面由寿星、青松、仙鹤和伏鹿构成，象征着福、禄、寿。在寺庙门口的左右还各有一只石狮，说明这座喇嘛庙融合了藏传佛教文化和汉文化。按照藏传佛教，绕着寺庙顺时针走三圈可以祈福和许愿。
